Верхоянск расположен на правом берегу реки Яна, в 92 км к юго-западу от административного центра улуса Батагая. Самый северный город Якутии и один из самых маленьких населённых пунктов в России, имеющих статус города.
Он известен как Полюс холода Северного полушария планеты. Самая низкая температура −67,8 °C была зарегистрирована здесь 15 января 1885 года.
Был основан в 1638 году как казачье зимовье Посником Ивановым.
Образует городское поселение город Верхоянск.